Секвенирование ДНК , метод, используемый для определения нуклеотидной последовательности ДНК. Знание последовательности сегмента ДНК имеет множество применений. Его можно использовать для поиска генов, сегментов ДНК, кодирующих определенный белок или фенотип.
1. SNP-типирование — это анализ
1) аффинности;
2) однонуклеотидных полиморфизмов;+
3) титра иммуноглобулинов класса G;
4) экспрессии белка.
2. ddNTP — это
1) ионы для поддержания необходимой pH в реакции;
2) нуклеотиды, обеспечивающие обрыв цепи;+
3) нуклеотиды, обеспечивающие синтез цепи;
4) фермент, обеспечивающий синтез цепи.
3. АТФ-сульфарилаза необходима для:
1) биотинилированияпраймера;
2) комплементарного встраивания нуклеотида;
3) обнаружения белка в реакции;
4) получения АТФ из пирофосфата.+
4. Аденин комплементарен:
1) гуанину;
2) тимину;+
3) фосфотидилхолину;
4) цитозину.
5. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов — это
1) анализ последовательности мРНК;
2) изучение афинности;
3) изучение первичной аминокислотной последовательности;
4) способ исследования геномной ДНК путём ее разрезания с помощью эндонуклеаз рестрикции и дальнейший анализ фрагментов.+
6. В развитии полигенных заболеваний полиморфизмы могут являться:
1) ключевым фактором патогенеза;
2) не имеющими значения факторами;
3) определяющим механизмом клинической картины;
4) фактором предрасположенности.+
7. В состав ДНК входят:
1) ЛПС;
2) азотистое основание;+
3) дезоксирибоза;+
4) остаток фосфорной кислоты.+
8. Выберите этапы проведения пиросеквенирования
1) получение одноцепочеченой ДНК;+
2) постановка ПЦР;+
3) связывание эпитопа и паратопа;
4) севенирование путем синтеза.+
9. Делеция участка ДНК — это
1) вставка фрагмента ДНК в геном;
2) обмен между гомологичными хромосомами;
3) поворот нуклеотидной последовательности в геноме на 180 градусов;
4) потеря участка ДНК в геноме.+
10. Длина фрагмента ДНК, который амплифицируется для реакции пиросеквенирования
1) 100-300;+
2) 1000-1500;
3) 400-500;
4) 900-950.
11. Инсерция участка ДНК
1) вставка фрагмента ДНК в геном;+
2) робертсоновская транслокация;
3) увеличение количества повторов в некодирующей части гена;
4) усиление активности промотора гена.
12. Капиллярный электрофорез используется в:
1) NGS;
2) вестерн-блоте;
3) пиросеквенировании;
4) секвенировании по Сенгеру.+
13. Люциферазо-опосредованная реакция заключается в:
1) обеспечения присоединения нуклеотида в растущую цепь;
2) окислениилюциферина в оксилюциферин;+
3) получении АТФ;
4) удалении побочных продуктов реакции.
14. Области применения секвенирования:
1) snp-типирование;+
2) анализ титра иммуноглобулинов класса Е;
3) генетическая диагностика различных заболеваний;+
4) определение активности ферментов;
5) секвенирования denovo.+
15. Однонуклеотидный полиморфизм — это
1) отличия в последовательности ДНК в несколько нуклеотидов в геноме представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом;
2) отличия в последовательности ДНК в один нуклеотид в геноме представителей одного вида или между гомологичными участками гомологичных хромосом;+
3) различия в белковой последовательности;
4) различия в длине генов у представителей одного вида.
16. Пиросеквенирование — это метод секвенирования основанный на
1) детекции изменения pH при синтезе цепи ДНК;
2) детекциивы свобождающегося пирофосфата при элонгации цепи ДНК;+
3) лигировании;
4) обрыве цепи.
17. Полиморфизмы, не выраженные фенотипически, в лабораторной практике используют для:
1) идентификации личности;+
2) определения количества лимфоцитов;
3) определения титра антител при инфекционных заболеваниях;
4) уровня экспрессии TLRна поверхности клеток.
18. Правило Чаргаффа гласит, что количество
1) адениловых оснований равно количеству гуаниловых;
2) адениловых оснований равно количеству тимидиловых;+
3) тимидиловых оснований равно количеству гуаниловых;
4) цитозиловых оснований равно количеству гуаниловых.
19. Праймеры, которые используются для пиросеквенирования
1) прямой и обратный;
2) прямой и обратный биотинилированный;+
3) только обратный;
4) только прямой.
20. Преимущества пиросеквенирования
1) быстрая детекция однонуклеотидных полиморфизмов;+
2) возможность прочтения протяженных участков генома;
3) использование для прочтения CpG-мотивов;
4) параллельное секвенирование нескольких цепей ДНК.
21. Преимуществом секвенирования следующего поколения перед секвенированием по Сенгеру является:
1) большая точность;
2) высокая производительность;+
3) параллельноесеквенирование образцов нескольких пациентов;+
4) предсказание структуры белка.
22. При присоединении нуклеотида к цепи ДНК выделяется
1) АТФ;
2) ДНК-полимераза;
3) пирофосфат;+
4) фосфотаза.
23. Разновидности методик секвенирования следующего поколения
1) пиросеквенирование;+
2) секвенирование путем лигирования;+
3) секвенирование путем обрыва цепи;
4) секвенирование путем синтеза.+
24. Рестрикты — это
1) ферменты для получения библиотек ДНК;
2) ферменты, отщепляющие концевой нуклеотид;
3) фрагменты ДНК, полученные после обработки эндонуклеазами рестрикции;+
4) фрагменты мРНК.
25. Секвенирование ДНК — это
1) амплификация ДНК in vitro;
2) определение специфичности взаимодействия антиген-антитело;
3) определние последовательности мРНК;
4) прочтение последовательности ДНК.+
26. Секвенирование по Сенгеру позволяет прочитывать до
1) 400-500 нуклеотидов;
2) 500-600 нуклеотидов;
3) 600-700 нуклеотидов;
4) 900-1000 нуклеотидов.+
27. Секвенирования denovo — это
1) анализ профиля экспрессии генов;
2) определение эпигенетической регуляции;
3) расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК;+
4) ресеквенирование известных последовательностей.
28. Секвенрование по Сенгеру применятся для
1) валидации результатов секвенирования следующего поколения;+
2) идентификации мутаций;+
3) определения составасубпопуляций лимфоцитов крови;
4) определения титра антител.
29. Субстратами для реакции пиросеквенирования являются:
1) dNTP;
2) АДФ-5’-сульфарилаза;+
3) АТФ;
4) люциферин.+
30. Эндонуклеазы рестрикции — это
1) антитела к ДНК-полимеразе;
2) гидролазы, обеспечивающие гидролиз цепи ДНК в строго определенном месте;+
3) ферменты, катализирующие присоединение нуклеотидов;
4) ферменты, отщепляющие концевой нуклеотид с 3-конца.
